Le CESER est constitué de plusieurs instances :
L’assemblée plénière
Elle se réunit sous la présidence du Président du CESER. Elle a pour mission de voter les avis, rapports et productions des commissions.
Le bureau
Élu pour trois ans par l’assemblée, le bureau comporte 24 sièges : le Président, 18 vice-présidents et 5 membres. Les membres des premiers et seconds collèges y sont représentés à égalité.
L’instance de coordination et d’harmonisation (ICH)
Composée des Présidents de commissions, du vice-président délégué et assistée par les chargés d’études, cette instance a pour objectif de renforcer la transversalité et la cohérence des productions du CESER.
La conférence des présidents
La conférence des présidents a pour fonction de porter une stratégie d’ordre politique afin de préparer et organiser les travaux de l’assemblée. Elle est composée de l’ensemble des présidents de commissions et les vice-présidents ayant délégation.